Existujú dva spôsoby sterilizácie lekárskych nástrojov používaných v chirurgii, a to sterilizácia pri vysokej teplote a sterilizácia pri nízkej teplote.
1. Vysokoteplotnou sterilizačnou metódou je použitie vysokého tepla na denaturáciu mikrobiálnych proteínov, aby sa dosiahol účel zabíjania baktérií. Je klinicky najpoužívanejšia a bežne sa používa tlaková parná sterilizácia, ktorá je vhodná pre nástroje a predmety, ktoré znesú vysokú vlhkosť a teplo. K dispozícii je tiež blesková parná sterilizácia, ktorú možno použiť na holé nástroje a predmety.
Po druhé, sterilizácia pri nízkej teplote, často s použitím sterilizácie etylénoxidom. Najklinickejšie použitie, výhodou je, že nepoškodzuje sterilizované predmety, má silnú penetračnú schopnosť a má dobrý účinok na ničenie mikroorganizmov. Nízkoteplotná parná sterilizácia formaldehydom sa môže použiť pre zdravotnícke pomôcky, ktoré neznesú vysoké teploty.
